Francesco Flarer nacque il 27 novembre 1791 vicino a Merano in Tirolo; fu mandato nel Collegio benedettino di Merano e ad Innsbruck per seguire i corsi di Teologia, poiché i genitori desideravano per lui una carriera ecclesiastica; qui invece si iscrisse alla Facoltà di Medicina. Nel 1809 si recò a Pavia dove si laureò con lode il 15 giugno del 1815 in Medicina, il 29 giugno in Chirurgia. Lo Scarpa lo inviò a Vienna per perfezionarsi in Oculistica dove rimase per due anni; a Pavia il 28 giugno 1819 ottenne la cattedra di Oculistica, materia che insegnò fino all’anno della sua morte. Fondò anche una nuova clinica inaugurata il 22 ottobre 1819; ricoprì la carica di rettore nel 1832 e fu decano della Facoltà di Medicina nel 1854. Morì a Pavia il 22 dicembre 1859, lasciando due figli maschi e sei femmine, di cui Amalia andò in sposa ad Agostino De Pretis.